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這篇文章主要為大家展示了“CIRCpedia數據庫怎么用”，內容簡而易懂，條理清晰，希望能夠幫助大家解決疑惑，下面讓小編帶領大家一起研究并學習一下“CIRCpedia數據庫怎么用”這篇文章吧。
CIRCpedia是一個綜合性的環狀RNA數據庫，采用CIRCexplorer軟件分析了來自6個物種約180多個樣本的轉錄組數據，識別到了262782個環狀RNA,網址如下
http://www.picb.ac.cn/rnomics/circpedia/
各個物種環狀RNA的數據量匯總如下
表格數據對應的環形圖示意如下
可以看到，絕大部分還是人和小鼠的環狀RNA,對于這兩個物種的環狀RNA,提供了保守性分析的結果。通過官網的4大功能，我們可以方便的探究不同物種的環狀RNA數據，分析在不同組織和樣本中的表達量信息。
可以通過物種，細胞系，基因名稱或者基因組位置，circpedia中的環狀RNA ID進行檢索，檢索框示意如下
檢索結果示意如下
給出了環狀RNA ID,來源基因，對應的線性轉錄本，表達量，外顯子的起始和終止位置，細胞系，保守性等信息。
通過JBowse基因組瀏覽器查看相關數據，示意如下
可以方便的下載數據庫中的信息，示意如下
可以用熱圖或者散點圖的形式展現環狀RNA在不同組織或者細胞系中的表達量，示意如下
第一步輸入環狀RNA ID, 第二步選擇物種，第三步選擇細胞系，可以多選，第四步選擇圖表類型，然后點擊Draw按鈕，在右邊的面板會顯示對應的結果。
通過該數據庫的在線工具，可以方便的探究不同物種的環狀RNA和不同細胞系中環狀RNA的表達量。
以上是“CIRCpedia數據庫怎么用”這篇文章的所有內容，感謝各位的閱讀！相信大家都有了一定的了解，希望分享的內容對大家有所幫助，如果還想學習更多知識，歡迎關注億速云行業資訊頻道！
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