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circRNADisease數據庫怎么用

發布時間:2022-01-15 17:43:44 來源:億速云 閱讀:236 作者:小新 欄目:大數據

小編給大家分享一下circRNADisease數據庫怎么用,相信大部分人都還不怎么了解,因此分享這篇文章給大家參考一下,希望大家閱讀完這篇文章后大有收獲,下面讓我們一起去了解一下吧!

circRNA在生命活動中發揮著調控作用,在腫瘤等疾病中更是扮演著重要角色。circRNADisease是一個手工整理的疾病相關的環狀RNA數據庫,網址如下

http://cgga.org.cn:9091/circRNADisease/

目前該數據庫中收錄了330個circRNA,48種疾病,354個circRNA和疾病之間的關聯數據。通過導航欄的Browser菜單,可以根據以下兩種類型查看相關數據

  1. circRNAs

  2. Diseases


以肺癌為例,結果如下所示

circRNADisease數據庫怎么用

該數據庫中的環狀RNA包括circBase id和circRNA name兩種,對于每個環狀RNA和疾病的關聯數據,給出了檢測的方式,環狀RNA在患病者中的表達趨勢,相關文獻的pubmed id,點擊details可以查看詳細信息

1. circRNA  basic information

circRNADisease數據庫怎么用

2. disease basic information

circRNADisease數據庫怎么用

3. other information

circRNADisease數據庫怎么用

通過該數據庫,可以方便得到已經報導的環狀RNA與疾病的關聯數據。值得一提的是,所謂的環狀RNA與疾病的關聯,其實就是檢測相比正常組織,患者組織中差異表達的環狀RNA,方法包括轉錄組測序,芯片,qPCR等手段,只是一種簡單的關聯,并沒有深入挖掘circRNA在疾病中的具體作用。

以上是“circRNADisease數據庫怎么用”這篇文章的所有內容,感謝各位的閱讀!相信大家都有了一定的了解,希望分享的內容對大家有所幫助,如果還想學習更多知識,歡迎關注億速云行業資訊頻道!

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