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這篇文章給大家分享的是有關怎么使用R語言篩選基因的內容。小編覺得挺實用的，因此分享給大家做個參考，一起跟隨小編過來看看吧。
篩選基因
myfpkm<-read.table("All_gene_fpkm.txt",header=TRUE,comment.char="",sep = "\t",check.names=FALSE,row.names=1)
head(myfpkm)
myfpkm[order(rowSums(myfpkm),decreasing=T)[1:5000],] #篩選表達量高的前5000個基因
myfpkm[rowSums(myfpkm)>1,] #篩選掉表達量低的基因
minRowFPKM=rowMeans(myfpkm)>2 #按平均數篩選
minNumFPKM=rowSums(myfpkm>0)>10 #表達量不為0的樣品個數篩選
myfpkm=myfpkm[minRowFPKM & minNumFPKM,] #聯合一下感謝各位的閱讀！關于“怎么使用R語言篩選基因”這篇文章就分享到這里了，希望以上內容可以對大家有一定的幫助，讓大家可以學到更多知識，如果覺得文章不錯，可以把它分享出去讓更多的人看到吧！
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