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本文小編為大家詳細介紹“WGCNA怎么根據KME值篩選hub基因”，內容詳細，步驟清晰，細節處理妥當，希望這篇“WGCNA怎么根據KME值篩選hub基因”文章能幫助大家解決疑惑，下面跟著小編的思路慢慢深入，一起來學習新知識吧。
WGCNA分析中需要找出模塊中也就共表達網絡中的hub基因：
這里可以根據：KME (eigengene connectivity)值來篩選hub基因：Hub genes are those that show most connections in the network as indicated by their high KME (eigengene connectivity) value
代碼部分很簡單，輸出所有的基因與模塊的KME矩陣，然后篩選每個模塊中kme最大的前幾個基因就是hub基因：
#mergedMEs是經過相似模塊合并之后的最終模塊對應的模塊特征基因： MEs = mergedMEs #輸出結果： datKME=signedKME(datExpr, MEs, outputColumnName="kME_MM.") write.csv(datKME, "kME_MM_test.csv")
讀到這里，這篇“WGCNA怎么根據KME值篩選hub基因”文章已經介紹完畢，想要掌握這篇文章的知識點還需要大家自己動手實踐使用過才能領會，如果想了解更多相關內容的文章，歡迎關注億速云行業資訊頻道。
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