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這篇文章主要介紹了TSGene是什么數據庫，具有一定借鑒價值，感興趣的朋友可以參考下，希望大家閱讀完這篇文章之后大有收獲，下面讓小編帶著大家一起了解一下。
抑癌基因tumor suppressor gene，簡稱TSG,是一類存在于正常細胞內，可以抑制細胞生長并且具有潛在抑癌作用的基因。TSGene是一個從文獻中收集整理的抑癌基因數據庫
數據庫的網址如下
https://bioinfo.uth.edu/TSGene/
最新版本為v2.0版本，共收錄了1217個human TSGs, 其中包含1018個蛋白編碼基因和199個lncRNA，同時對這些基因進行了多種注釋，包括表達量，突變位點，蛋白相互作用等注釋信息。通過官網的Query菜單，可以檢索基因的詳細信息，以BRCA1為例，結果如下
包含了基因名稱，染色體位置，對應的pathway與疾病，序列等信息，示意如下
展示了該基因相關的文獻和摘要信息，示意如下
展示該基因在不同腫瘤的正常和患病樣本的表達量信息，以及差異分析的結果，示意如下
包含了以下四種調控信息
miRNA與該基因的調控關系
轉錄因子與該基因的調控關系
該基因的轉錄后修飾
該基因的甲基化表達譜
利用miRTarBase數據庫中的miRNA靶基因信息，提供了如下所示的miRNA調控網絡，示意如下
利用TransFac數據庫提供了調控該基因的轉錄因子信息，示意如下
利用Uniprot數據庫提供了該基因的轉錄后修飾信息，示意如下
利用DiseaseMeth數據庫提供了該基因上的甲基化位點表達譜信息，示意如下
利用COSMIC數據庫，提供了該基因上的體細胞突變和CNV位點信息，體細胞突變的結果示意如下
提供了基因的相互作用信息，其相互作用來源于多個數據庫，示意如下
數據庫中的信息是免費下載的，這個數據庫和ONGene數據庫正好互補，對于腫瘤研究而言，這兩個數據庫都非常值得參考。
感謝你能夠認真閱讀完這篇文章，希望小編分享的“TSGene是什么數據庫”這篇文章對大家有幫助，同時也希望大家多多支持億速云，關注億速云行業資訊頻道，更多相關知識等著你來學習!
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