Epifactors是什么數據庫

這篇文章主要介紹了Epifactors是什么數據庫，具有一定借鑒價值，感興趣的朋友可以參考下，希望大家閱讀完這篇文章之后大有收獲，下面讓小編帶著大家一起了解一下。

對于DNA甲基化，組蛋白修飾，染色質重塑等表觀遺傳標記分子的研究迅猛發展，在相關領域已經積累了大量的認知。通過對研究表明的參與這些表觀遺傳機制的蛋白對應的基因，功能進行整理和歸納，構建了Epifactors數據庫，網址如下

http://epifactors.autosome.ru/

為了提供更加全面和豐富的認知，在傳統的直接參與表觀遺傳的蛋白的基礎上，定義了表觀因子這個概念，將直接參與表觀遺傳的核心蛋白和其周邊蛋白聯系起來，進一步豐富了表觀遺傳中相關分子的網絡結構。

將以下幾種蛋白定義為表觀因子

1. Proteins acting as histones, histone variants or protamines;

2. Proteins performing post-translational modifications of histones or recognizing such modifications (histone modification ‘writers’, ‘erasers’ or ‘readers’);

3. Proteins changing the general structure of chromatin (performing chromatin remodeling), including Proteins that move, eject or restructure nucleosomes (ATP-dependent chromatin remodelers) and proteins that incorporate histone variants into the nucleosomes.

4. Proteins assisting histone folding and assembly;

5. Proteins acting upon modifications of DNA or RNA in such a way that it affects gene expression, but not through RNA processing;

6. Protein cofactors forming complexes with epigenetic factors, where complex formation is important for the activity.

   
   

對這些因子對應的基因，蛋白，產物，構成的蛋白復合體進行了詳細注釋，提供了更加完整的信息鏈。對于表觀因子的功能進行了分類，幾種主要功能相關的因子數量統計如下

官網提供了以下3種類型的檢索和查看方式

1. Genes

2. Complexes

3. Histones and Protamines

   
   

以Genes為例，結果如下所示

可以看到gene symbol, 蛋白ID, domain, 功能，功能，構成的蛋白復合體，調控的目標分子等信息。

同時部分因子還提供了在不同細胞系和組織中的表達量數據，示意如下

該數據庫中的信息是免費下載的，示意如下

該數據庫對于表觀遺傳領域的研究人員而言，是一個非常值得參考的數據庫，可以快速對某個表觀因子的功能有一個較為完整的認知。

感謝你能夠認真閱讀完這篇文章，希望小編分享的“Epifactors是什么數據庫”這篇文章對大家有幫助，同時也希望大家多多支持億速云，關注億速云行業資訊頻道，更多相關知識等著你來學習!