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這篇文章主要介紹了RNAcentral是什么數據庫，具有一定借鑒價值，感興趣的朋友可以參考下，希望大家閱讀完這篇文章之后大有收獲，下面讓小編帶著大家一起了解一下。
RNAcentral是由EBI開發的一個非編碼RNA數據庫，整合了Ensembl,GENCODE,LNCipedia, miRbase, Rfam等多個數據庫中的非編碼RNA信息，旨在為ncRNA的研究提供一個統一的參照，網址如下
https://rnacentral.org/
目前最新版本為v10, 整合了來自miRBase v22和LNCipedia 5.0版本的最新數據，同時新增了reads mapping和GO 注釋，示意如下
整合的所有數據庫列表見如下鏈接
https://rnacentral.org/expert-databases
示意圖如下
對于每一條非編碼RNA的序列，RNAcentral會給出1個唯一的編號Unique RNA Sequence identifier，前綴為URS ，后面是10個數字和字母的組合，比如URS0000000001, URS00000478B7， URS編號符合 /URS[0-9A-F]{10}/ 正則表達式。
RNAcentral 提供了3種檢索方式
通過text search這種檢索方式，我們可以選擇下列幾種過濾方式，對數據進行篩選
篩選好之后，可以點擊右上角進行下載
通過sequence search檢索方式，我們可以對一條序列進行注釋
輸入一條fasta 序列，RANcentral 會使用 nhmmer 進行比對，將比對上的數據庫中的序列輸出，這樣我們就可以對序列進行注釋了，判斷它是哪種非編碼RNA。
該數據庫提供了FTP和API服務，用于抓取數據，FTP的地址如下
ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/RNAcentral
通過該數據庫，我們可以方便的對各種ncRNA進行注釋。
感謝你能夠認真閱讀完這篇文章，希望小編分享的“RNAcentral是什么數據庫”這篇文章對大家有幫助，同時也希望大家多多支持億速云，關注億速云行業資訊頻道，更多相關知識等著你來學習!
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