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進化樹美化,要求使用以下瀏覽器打開,不支持IE瀏覽器和360瀏覽器
然后在配置文件里面輸入,需要添加顏色的分組信息,如下:
AT2G04880.1,AT2G30250.1 blue ad AT4G01250.1,AT4G31550.1 red ad AT4G39410.1,AT5G49520.1 yellow ad
第一列為,從一個基因到另一個基因之間,表示范圍;第二列,為設置顏色,最后一列 ad表示為所有枝設置顏色;列和列之間注意用tab分隔開;
這是設置的配置文件內容如下 ,與分支顏色設置相似,也支持單獨基因設置顏色(最后一行);點擊紅色箭頭處,然后將以下內容粘貼上去:官方配置說明
AT4G31550.1,AT4G01250.1 red ad AT2G30250.1,AT2G04880.1 blue ad AT1G80840.1 yellow
可點擊上圖圖紅框框處查看官方詳細配置說明;配置文件如下:官方說明
AT4G01720.1,AT1G55600.1 red ad AT2G40740.1,AT4G23810.1 green ad
設置參數如下,第一列為基因的ID,后面為設置形狀以及顏色,上圖圖紅框框處查看官方詳細配置說明。詳細說明見官方文檔。
AT4G01250.1 triangle,red:red AT3G58710.1 triangle,red:red AT1G29280.1 triangle,red:red AT2G34830.1 triangle,red:red AT1G30650.1 triangle,red:red AT5G52830.1 triangle,red:red AT4G23550.1 triangle,red:red AT2G21900.1 triangle,red:red AT5G45050.1 triangle,red:red AT2G30590.1 triangle,red:red AT2G24570.1 triangle,red:red AT3G04670.1 triangle,red:red AT2G23320.1 triangle,red:red AT5G28650.1 triangle,red:red AT4G24240.1 triangle,red:red AT4G31550.1 triangle,red:red AT2G04880.1 star,blue:blue AT5G56270.1 star,blue:blue AT4G26440.1 star,blue:blue AT3G01080.1 star,blue:blue AT4G12020.1 star,blue:blue AT2G03340.1 star,blue:blue AT4G26640.1 star,blue:blue AT1G13960.1 star,blue:blue AT2G37260.1 star,blue:blue AT2G38470.1 star,blue:blue AT5G07100.1 star,blue:blue AT2G30250.1 star,blue:blue
添加分組圓環,設置按鈕如下:
設置文件說明,官方詳細說明:DatasetGroupLabel.md:
!grouplabelcolor=black,fontsize=14,fontcolor=black,linewidth=2 AT4G01250.1,AT4G31550.1 text=group1,fontcolor=red,linewidth=4 AT4G39410.1,AT5G49520.1 text=group2,linecolor=darkgrey,fontcolor=purple,linestyle=dashed AT5G01900.1,AT1G66560.1 text=group3,color=darkgreen,textorientation=vertical,linewidth=4,fontsize=16
說明如下,帶!號的行為全局變量,也就是默認設置參數;其他第一列用,號隔開表示范圍,空格之后為各種group分組圓環的顯示方式:text為分組名稱,fontcolor為字體顏色,linewidth圓環粗細,textorientation控制分組名稱對齊樣式。
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