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這篇文章主要介紹了OncoKB數據庫有什么用，具有一定借鑒價值，感興趣的朋友可以參考下，希望大家閱讀完這篇文章之后大有收獲，下面讓小編帶著大家一起了解一下。
OncoKB收集了腫瘤發生發展相關的，具有臨床意義的基因組變異信息，對于每個變異，提供了其對應的生物學效應，藥物互作，預后和治療意義等詳細信息。
數據庫的網址如下
http://oncokb.org/
該數據庫以基因為中心，提供了每個基因上的變異，相關腫瘤類型，實驗證據等信息，示意如下
根據實驗證據的來源和可信度，劃分為下圖所示的不同等級
其中level1和level 2A是具有臨床意義的基因組變異，通過Actionable Genes菜單，可以查詢基因組變異與藥物的互作信息，示意如下
點擊每個基因ID, 可以查看該基因上所有的基因組變異，分為兩類
Clinically Relevant Alterations
All Annotated Alterations
以ABL1為例，示意如下
通過Cacner Genes菜單，可以查詢腫瘤原癌基因和抑癌基因的列表，示意如下
除了查詢功能外，該數據庫還提供了命令行工具，用于注釋自己的基因組變異信息，支持SNV, CNV, 融合基因等信息的注釋，該工具名為oncokb-annotator, 網址如下
https://github.com/oncokb/oncokb-annotator
該數據庫中的信息已經被整合到了cBioPortal中，可以幫助科學家們更好的開展腫瘤研究。
感謝你能夠認真閱讀完這篇文章，希望小編分享的“OncoKB數據庫有什么用”這篇文章對大家有幫助，同時也希望大家多多支持億速云，關注億速云行業資訊頻道，更多相關知識等著你來學習!
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