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本篇文章給大家分享的是有關染色質相互作用數據庫4DGenome是怎樣的，小編覺得挺實用的，因此分享給大家學習，希望大家閱讀完這篇文章后可以有所收獲，話不多說，跟著小編一起來看看吧。
4DGenome是一個染色質相互作用數據庫，采用了文獻檢索和軟件預測兩種手段來得到染色質相互作用，收錄了來自5個不同物種共7百多萬條互作記錄，網址如下
https://4dgenome.research.chop.edu/
涵蓋的5個物種列表如下
Homo sapiens(hg19)
Mus musculus(mm9)
Drosophila melanogaster(dm3)
Plasmodium falciparum(3D7)
Saccharomyces cerevisiae(sacCer3)
該數據庫中收錄的染色質互作信息來源于以下多種技術手段
3C
4C
5C
Capture-C
ChIA-PET
Hi-C
IM-PET
不同物種和不同技術手段對應的數量顯示如下
輸入基因組區域或者基因名稱，都可以檢索相關信息，檢索框示意如下
檢索結果如下所示
點擊Details可以查看詳細的互作信息，InteractorA和InteractorB給出了互作的兩個染色質區域的位置信息，Agene和Bgene表示與互作區域存在overlap的基因名稱, Contact Frequency表示互作頻率，LInk鏈接的是pubmed數據庫，可以查看對應的具體文獻。
通過該數據庫，可以檢索多個物種的染色質互作信息。
以上就是染色質相互作用數據庫4DGenome是怎樣的，小編相信有部分知識點可能是我們日常工作會見到或用到的。希望你能通過這篇文章學到更多知識。更多詳情敬請關注億速云行業資訊頻道。
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