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這篇文章主要為大家展示了“RADAR數據庫有什么用”，內容簡而易懂，條理清晰，希望能夠幫助大家解決疑惑，下面讓小編帶領大家一起研究并學習一下“RADAR數據庫有什么用”這篇文章吧。
RNA編輯作為一種重要的轉錄后調控機制，是轉錄組研究中的熱點。在不同類型的RNA編輯中，A->I的RNA編輯是最常見的，有許多的軟件可以用于識別這種類型的RNA編輯。
RADAR數據庫收集整理了human, mouse, fly等多個物種的RNA編輯位點的證據，并進行了手工注釋，提供了基于web頁面的查詢方式，網址如下
http://rnaedit.com/
通過官網的查詢功能，可以方便的進行檢索，示意圖如下
選擇對應的物種，然后提供了多種檢索條件，可以按照染色體位置查詢，也可以直接查詢某個基因相關RNA編輯位點。
在該數據庫中，對于RNA編輯位點所在的位置，提供了以下兩種注釋。
第一種是基因組特征區域，比如5’UTR, 3’UTR等,第二種是重復元件的注釋，大量研究發現RNA編輯位點在Alu重復序列中廣泛存在，而RADAR根據RNA編輯位點所在重復區域的特征，劃分成了Alu重復序列，非Alu重復序列，非重復序列3個特征區域。
同時也提供了RNA編輯位點在物種間的保守性，比如查詢human和mouse兩個物種間保守的RNA編輯位點。
以human AHR基因為例，查詢結果示意如下
點擊Position對應的鏈接，可以跳轉到UCSC基因組瀏覽器，具體的查看某個RNA編輯位點，Reference給出了對應的文獻，而Editing levels則給出了不同組織中RNA編輯位點的表達量，示意如下
有助于研究RNA編輯位點的組織特異性。該數據庫提供了下載功能，示意如下
可以直接下載不同物種的RNA編輯位點數據，對于human,還可以單獨下載某種重復序列區域的RNA編輯位點。
以上是“RADAR數據庫有什么用”這篇文章的所有內容，感謝各位的閱讀！相信大家都有了一定的了解，希望分享的內容對大家有所幫助，如果還想學習更多知識，歡迎關注億速云行業資訊頻道！
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