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這篇文章給大家介紹R語言ggtree如何按照指定的節點旋轉樹，內容非常詳細，感興趣的小伙伴們可以參考借鑒，希望對大家能有所幫助。
R語言里的ggtree這個包可視化進化樹有一個默認的順序，如果想要改變枝的相對位置應該如何實現呢？通過查找ggtree作者寫的幫助文檔找到了對應的辦法，可以使用
rotate()函數
mtcars
df<-mtcars[,c(1,3:6)]
df
df.hclust<-hclust(dist(df))
library(ggtree)
ggtree(df.hclust)+
geom_tiplab(offset = 2)+
xlim(NA,280)+
geom_highlight(node = 34,fill="blue")
我們看到圖上標記藍色的一個分支默認是在最底下的，如果想要把這個分支放到頂上應該如何修改呢？可以直接用ggtree中的
rotate()函數。rotate()接受兩個參數，一個是需要旋轉的節點。另外一個就是樹
ggtree(df.hclust)+
geom_tiplab(offset = 2)+
xlim(NA,280)+
geom_text(aes(label=node))
通過上圖我們看到需要旋轉的是33節點
p1<-ggtree(df.hclust)+
geom_tiplab(offset = 2)+
xlim(NA,280)
#geom_highlight(node = 34,fill="blue")
p2<-ggtree::rotate(p1,33)
p2+
geom_hilight(node=34,fill="blue")
這樣就把這一大塊放到上面去了。
細心的讀者可能發現了，這里在使用rotate（）這個函數的時候寫法是
ggtree::rotate(p1,33),這樣是為了使用指定包里的某個函數，因為R語言里的函數很多，有可能會重名，有時候你用到的函數可能并不是想實現功能的那個函數，所以比較保險的做法還是加上包的命名然后用兩個冒號鏈接函數
ggtree(df.hclust)+
geom_tiplab(angle=90,offset = -70)+
layout_dendrogram()
關于R語言ggtree如何按照指定的節點旋轉樹就分享到這里了，希望以上內容可以對大家有一定的幫助，可以學到更多知識。如果覺得文章不錯，可以把它分享出去讓更多的人看到。
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