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這篇文章主要為大家展示了“Pacbio三代全長轉錄組中融合基因的示例分析”，內容簡而易懂，條理清晰，希望能夠幫助大家解決疑惑，下面讓小編帶領大家一起研究并學習一下“Pacbio三代全長轉錄組中融合基因的示例分析”這篇文章吧。
Pacbio三代全長轉錄組(Iso-Seq 3) 中融合基因的分析，可以采用Cupcake 中的“fusion_finder.py” 這個腳本來分析。
fusion_finder.py --input hq_isoforms.fastq --fq -s hq_isoforms.fastq.sorted.sam -o lq_isoforms.fasta.fusion --cluster_report_csv cluster_report.csv
參數說明：
hq_isoforms.fastq : 這個文件是在polish的結果中的hq fastq
hq_isoforms.fastq.sorted.sam : 這個是和基因組比對的sam
lq_isoforms.fasta.fusion: 這個是輸出結果
cluster_report.csvZ: 這個是在cluster過程中的報告結果
以上是“Pacbio三代全長轉錄組中融合基因的示例分析”這篇文章的所有內容，感謝各位的閱讀！相信大家都有了一定的了解，希望分享的內容對大家有所幫助，如果還想學習更多知識，歡迎關注億速云行業資訊頻道！
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