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這篇文章主要介紹“如何下載miRNA的5p, 3p 表達量”,在日常操作中,相信很多人在如何下載miRNA的5p, 3p 表達量問題上存在疑惑,小編查閱了各式資料,整理出簡單好用的操作方法,希望對大家解答”如何下載miRNA的5p, 3p 表達量”的疑惑有所幫助!接下來,請跟著小編一起來學習吧!
參考如下的代碼:
# 設置下載的參數 project <- "TCGA-CHOL" data_category <- "Transcriptome Profiling" data_type <- "Isoform Expression Quantification" workflow_type <- "BCGSC miRNA Profiling" legacy <- FALSE # 查詢可以下載的數據,有時候查詢的API不穩定,需要多試幾次 query <- GDCquery(project = project, data.category = data_category, data.type = data_type, legacy = legacy) # 下載數據 GDCdownload(query = query,method='client')
其關鍵是設置data_type 為“Isoform Expression Quantification”, 這樣就是不同isoform 的表達量。
到此,關于“如何下載miRNA的5p, 3p 表達量”的學習就結束了,希望能夠解決大家的疑惑。理論與實踐的搭配能更好的幫助大家學習,快去試試吧!若想繼續學習更多相關知識,請繼續關注億速云網站,小編會繼續努力為大家帶來更多實用的文章!
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