GSDS網站docker鏡像本地構建的示例分析

這篇文章主要介紹GSDS網站docker鏡像本地構建的示例分析，文中介紹的非常詳細，具有一定的參考價值，感興趣的小伙伴們一定要看完！

GSDS網站docker鏡像本地構建

GSDS網站有時候打不開，可能服務器沒有人維護，原網站：http://gsds.cbi.pku.edu.cn/index.php   備用網站：http://gsds.gao-lab.org/index.php 

這里為了方便大家使用GSDS，繪制基因結構圖，組學大講堂免費提供一個鏡像使大家可以在自己的電腦上搭建一個GSDS網站，這樣就永遠不會打不開網站了，具體方法如下：

搭建網站系統環境：
操作系統：win10教育版，
docker：docker桌面版本

1.下載組學大講堂提供的專門為GSDS定制的docker鏡像

> docker search omicsclass   #搜索鏡像
NAME                           DESCRIPTION                                     STARS               OFFICIAL            AUTOMATED
omicsclass/gene-family         gene-family analysis docker image               4
omicsclass/rnaseq              RNA-seq analysis docker image build by omics…   3
omicsclass/reseq               whole genome resequence analysis                1
omicsclass/blast-plus          blast+ v2.9.0                                   0
omicsclass/biocontainer-base   Biocontainers base Image centos7                0
omicsclass/isoseq3             isoseq3 v3.3.0 build by omicsclass              0
omicsclass/bwa                 BWA v0.7.17 build by omicsclass                 0
omicsclass/samtools            samtools v1.10 build by omicsclass              0
omicsclass/blastall            legacy blastall v2.2.26                         0
omicsclass/sratoolkit          SRAtoolkit v2.10.3 and aspera v3.9.9.177872     0
omicsclass/ampliseq-q2         Amplicon sequencing qiime2 v2020.2 image        0
omicsclass/bsaseq              NGS Bulk Segregant Analysis image               0
omicsclass/ampliseq-q1         Amplicon sequencing qiime1 v1.9.1 image         0
omicsclass/gwas                gwas analysis images                            0

> docker pull omicsclass/gsds-v2  #下載鏡像

2.下載GSDS網站源代碼下載：gsds_v2.zip  ，然后解壓文件到一個目錄：

我這里解壓到了：D:\gsds_v2

3.啟動docker鏡像：

>     #查看后臺鏡像
REPOSITORY               TAG                 IMAGE ID            CREATED             SIZE
omicsclass/gsds-v2       latest              d77e054c3744        8 hours ago         2.54GB
mattrayner/lamp          latest              05750cfa54d5        5 days ago          915MB
omicsclass/bsaseq        latest              d5ed7a70bfc8        13 days ago         9.77GB
omicsclass/reseq         v1.1                da154448a90f        4 weeks ago         8.83GB
omicsclass/gene-family   v1.0                2d1d640726dd        3 months ago        4.53GB
>          #后臺啟動docker網站服務器，注意目錄映射-v 參數， 解壓的目錄D:\gsds_v2

4.打開網站使用本地GSDS網站：

網站本地地址：127.0.0.1   ，如果網站沒有打開，可以稍等一下，后臺服務啟動需要時間；

以上是“GSDS網站docker鏡像本地構建的示例分析”這篇文章的所有內容，感謝各位的閱讀！希望分享的內容對大家有幫助，更多相關知識，歡迎關注億速云行業資訊頻道！