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今天就跟大家聊聊有關HACER human增強子數據庫的示例分析，可能很多人都不太了解，為了讓大家更加了解，小編給大家總結了以下內容，希望大家根據這篇文章可以有所收獲。
大多數的增強子數據庫利用chip_seq,DNase_seq和CAGE_seq的數據來鑒定增強子, HACER則通過GRO_seq和PRO_seq來分析增強子RNA，從而達到鑒定已經激活的增強子的目的。
與其他增強子數據相比較的情況示意如下
該數據庫的網址如下
http://bioinfo.vanderbilt.edu/AE/HACER/
對于鑒定到的增強子區域，該數據庫同樣提供了以下3種調控關系
TF-Enhancer
Enhancer-target gene
Enhancer-promoter
同時對于增強子對應的基因組區域，還提供了該區域內的GWAS SNP和eQTL 變異位點信息，圖示如下
由于增強子的組織和細胞特異性，在該數據庫中通過Browser菜單，可以瀏覽不同細胞系中的增強子信息，示意如下
勾選感興趣的細胞系前的單選框進行查看，以GM12878為例，檢索結果示意如下
點擊增強子ID,可以查看詳細信息, 以AE_hg19_GM12878_20878`為例，結果如下所示
該數據庫中的信息是免費下載的，通過該數據庫，可以方便的探索增強子，TF, 基因的調控網絡，還可以結合突變信息，將基因組和轉錄調控多層次，多組學的數據結合起來使用，對于探究具體的機制提供更多的參考信息。
看完上述內容，你們對HACER human增強子數據庫的示例分析有進一步的了解嗎？如果還想了解更多知識或者相關內容，請關注億速云行業資訊頻道，感謝大家的支持。
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