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GOA中Gene Ontology是怎樣注釋信息數據庫

發布時間:2021-12-02 09:31:23 來源:億速云 閱讀:209 作者:柒染 欄目:大數據

本篇文章為大家展示了GOA中Gene Ontology是怎樣注釋信息數據庫,內容簡明扼要并且容易理解,絕對能使你眼前一亮,通過這篇文章的詳細介紹希望你能有所收獲。

GOA全稱Gene Ontology Annotation, 是EMBL-EBI構建的一個GO注釋信息的數據庫。

該數據庫提供了以下3種生物分子的GO注釋信息

  1. 來自UniProtKB數據庫的蛋白

  2. 來自RNACentral數據庫的RNA

  3. 來自Complex數據庫的蛋白復合物

GOA數據庫的注釋信息不僅包括由Gene Ontology委員會的專家們提供的手工注釋,還包括由生物信息軟件注釋得到的GO注釋信息。詳細的來源如下

GOA中Gene Ontology是怎樣注釋信息數據庫

GOA的注釋信息可以通過QuickGO進行瀏覽,官網上則提供了FTP下載功能,主要包含以下2種文件

1. GO注釋信息

提供了UniProtKB數據庫中蛋白對應的GO注釋信息,同時對于常見的物種,還單獨提供了注釋文件。

GOA中Gene Ontology是怎樣注釋信息數據庫

2. Go Mapping 文件

提供了其他數據庫的ID和GO ID之間的對應關系,列表如下

GOA中Gene Ontology是怎樣注釋信息數據庫

FTP的地址如下

ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/GO/goa

GOA的注釋信息通過QuickGO進行瀏覽和檢索,通過FTP服務則可以下載對應的原始注釋信息。

上述內容就是GOA中Gene Ontology是怎樣注釋信息數據庫,你們學到知識或技能了嗎?如果還想學到更多技能或者豐富自己的知識儲備,歡迎關注億速云行業資訊頻道。

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