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linux操作命令舉例分析

發布時間:2021-11-23 15:47:39 來源:億速云 閱讀:141 作者:iii 欄目:大數據

這篇文章主要介紹“linux操作命令舉例分析”,在日常操作中,相信很多人在linux操作命令舉例分析問題上存在疑惑,小編查閱了各式資料,整理出簡單好用的操作方法,希望對大家解答”linux操作命令舉例分析”的疑惑有所幫助!接下來,請跟著小編一起來學習吧!

 解壓rar壓縮文件
tar -xf GSE58831_RAW.tar
   批量解壓gz壓縮文件
for i in $(ls *.gz); do bgzip -d $i;done
   cut指定分隔符分割文件

有人提問批量更改fasta序列名稱,他的fasta文件格式是

>seq1 | blabla
ATCG
>seq2 | bbbbb
ATCG
 

他想把序列名稱豎線后面的內容都去掉,我自己想到的辦法是python,識別大于號開頭的行,然后用豎線分割字符串,在寫到文件里就可以了,群里一位老師直接給出linux的cut命令

cat pra.fasta | cut -d "|" -f 1
 

簡單明了

-d指定分隔符,-f指定輸出分割后的第一列

 還遇到了一個問題是

在linux系統下,管理員安裝好的R語言,一些包都放到了指定的位置。每次在我自己的賬戶下想要調用這些包改如何實現,查到了一種方式是使用.libPaths()

比如R語言啟動以后先輸入命令

.libPaths(c("/A/B/C"))

到此,關于“linux操作命令舉例分析”的學習就結束了,希望能夠解決大家的疑惑。理論與實踐的搭配能更好的幫助大家學習,快去試試吧!若想繼續學習更多相關知識,請繼續關注億速云網站,小編會繼續努力為大家帶來更多實用的文章!

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