做企業服務器安全防護的方法有：1、制定內部數據安全風險管理制度；2、及時更新服務器中的軟件版本；3、定期對服務器數據進行備份；4、定期對服務器進行安全檢測；5、定期更新服務器系統以及軟件補丁；6、給服務器安裝并配置專業的網絡安全防火墻；7、給服務器安裝病毒查殺軟件；8、給服務器接入專業的高防服務。
具體內容如下：
1、制定內部數據安全風險管理制度
制定公司內部數據泄露和其他類型的安全風險協議，包括分配不同部門以及人員管理賬號、密碼等權限，定期更新密碼避免被黑客盜取，以及其他可行措施。
2、及時更新軟件版本
及時更新軟件版本，以避免你的服務器安全處于危險之中，使其漏洞被黑客利用并入侵。使用專業的安全漏洞掃描程序是一種保持軟件實時更新的方式之一。
3、保留數據備份
確保您的服務器已設置定期數據備份，這樣重要數據可在本地或其他位置生成備份，如果原始數據不幸損壞、丟失等情況發生時，你可以利用備份數據保證業務正常運行。
4、定期安全檢測
定期進行安全檢測，確保服務器安全，在非默認端口上設置標準和關鍵服務、保證防火墻處于最佳設置等，定期進行安全掃描，防止病毒入侵。
5、定期檢測更新系統和軟件補丁
定期安裝最新的操作系統和軟件更新/補丁，減少系統漏洞，提高服務器的安全性。
6、安裝專業的網絡安全防火墻
安裝防火墻，這樣進入服務器中的流量都是經常防火墻過濾之后的流量，防火墻內其他的流量直接被隔離出來，防火墻中一定要安裝入侵檢測和入侵防御系統，這樣才能發揮防火墻的最大作用。
7、安裝防病毒軟件掃描程序
安裝商業級反惡意軟件和反病毒引擎，對服務器進行實時保護。此外，每周一次 “全系統掃描”，以確保服務器系統的安全。
8、接入專業的高防服務
DDOS攻擊是目前最常見的攻擊方式，攻擊者利用大量“肉雞”模擬真實用戶對服務器進行訪問，通過大量合法的請求占用大量網絡資源，從而使真正的用戶無法得到服務的響應，是目前最強大、最難防御的攻擊之一。目前DDOS還沒有什么徹底解決的方法，只能通過專業的網絡高防服務進行防御，可以選用墨者盾高防來防御DDoS攻擊。
