在Java中，確保串口數據完整性的方法主要包括以下幾點：

1. 使用正確的波特率、數據位、停止位和奇偶校驗位：這些參數必須與連接設備的參數相匹配，以確保數據的正確傳輸。
2. 添加數據校驗：可以在發送數據時添加校驗和、CRC等校驗方式，接收端對數據進行校驗，如果不通過則重新請求發送。
3. 使用緩沖區：使用緩沖區可以接收和處理接收到的數據，同時也可以將數據寫入緩沖區，以便后續處理。
4. 處理異常：在讀寫串口數據時，可能會遇到各種異常情況，如讀取超時、寫入超時、數據錯誤等，需要對這些異常進行處理，以避免數據丟失或不完整。
5. 使用可靠的數據傳輸協議：例如，可以使用XMODEM協議等可靠的協議來傳輸數據，這些協議具有錯誤校驗和重傳等功能，可以確保數據的完整性。

以下是一個簡單的Java代碼示例，使用RXTX庫通過串口發送和接收數據，并添加了簡單的校驗和來確保數據的完整性：

import gnu.io.*;
import java.io.IOException;
import java.io.OutputStream;
import java.util.TooManyListenersException;

public class SerialCommunication {
    private static final String PORT = "COM1";
    private static final int BAUD_RATE = 9600;

    public static void main(String[] args) {
        SerialPort serialPort = null;
        OutputStream outputStream = null;

        try {
            // 獲取串口
            serialPort = (SerialPort) CommPortIdentifier.getPortIdentifier(PORT).open("SerialCommunicationApp", 2000);

            // 配置串口
            serialPort.setSerialPortParams(BAUD_RATE, SerialPort.DATABITS_8, SerialPort.STOPBITS_1, SerialPort.PARITY_NONE);

            // 獲取輸出流
            outputStream = serialPort.getOutputStream();

            // 發送數據
            String data = "Hello, Serial!";
            byte[] dataBytes = data.getBytes();
            int checksum = 0;
            for (byte b : dataBytes) {
                checksum += b;
            }
            dataBytes = new byte[]{checksum & 0xFF};
            outputStream.write(dataBytes);
            outputStream.flush();

            // 接收數據
            byte[] buffer = new byte[1024];
            int bytesRead = serialPort.read(buffer, 0, buffer.length);
            String receivedData = new String(buffer, 0, bytesRead);
            int receivedChecksum = (buffer[bytesRead - 1] & 0xFF);
            if (receivedChecksum == (checksum & 0xFF)) {
                System.out.println("數據接收成功: " + receivedData);
            } else {
                System.out.println("數據接收失敗: " + receivedData);
            }

        } catch (NoSuchPortException | PortInUseException | UnsupportedCommOperationException | IOException e) {
            e.printStackTrace();
        } finally {
            // 關閉資源
            if (serialPort != null) {
                serialPort.close();
            }
            if (outputStream != null) {
                try {
                    outputStream.close();
                } catch (IOException e) {
                    e.printStackTrace();
                }
            }
        }
    }
}

請注意，以上代碼僅是一個簡單的示例，實際應用中可能需要根據具體需求進行更復雜的數據處理和錯誤處理。同時，也需要確保已經正確安裝了RXTX庫，并且串口已經被正確配置和連接。