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dbsnp數據庫有何特色功能

小樊
82
2024-11-10 18:02:49
欄目: 大數據

DBSNP數據庫是一個由NCBI維護的大型數據庫,專門收錄人類基因組中的單核苷酸多態性(SNP)和短插入/缺失(indels)等遺傳變異信息。以下是關于DBSNP數據庫的特色功能介紹:

特色功能

  • 收錄內容全面:DBSNP數據庫不僅收錄了SNP和短插入/缺失多態性,還包括微衛星標記和短重復序列等數據。
  • 數據豐富:DBSNP數據庫已收集了超過1.84億份提交文件,代表了55種生物的超過6400萬種不同變種。
  • 支持多種查詢方式:用戶可以通過rs號、ss號等多種方式進行查詢,獲取特定SNP的詳細信息。
  • 數據更新和維護:DBSNP數據庫不斷更新,以包含最新的遺傳變異數據,確保數據的準確性和完整性。
  • 數據下載和訪問:DBSNP數據庫提供了多種格式的數據下載,包括FASTA格式的序列數據,方便用戶進行進一步分析。

數據庫結構

DBSNP數據庫采用“中心和輻條”模型,中心是包含主要表格的dbSNPmain,而輻條是包含具體生物體數據的子數據庫。

查詢示例

以檢索NAT5的不同SNP的基因序列為例,用戶可以通過NCBI首頁進入DBSNP,輸入rs號來查詢特定SNP的詳細信息,包括突變類型、堿基變化情況、人群頻率等。

DBSNP數據庫通過其全面的數據收錄、豐富的查詢方式、持續的數據更新和維護,以及便捷的數據下載和訪問功能,為遺傳學研究人員提供了一個強大的工具,幫助他們更好地理解和分析遺傳變異。

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