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BLAST中blastn和blastp的區別有哪些

小億
802
2023-08-03 15:40:29
欄目: 編程語言

BLAST中的blastn和blastp是兩個不同的搜索工具,其區別如下:

  1. 基本原理:blastn是用于核酸序列之間的比對,而blastp則是用于蛋白質序列之間的比對。

  2. 輸入類型:blastn接受核酸序列作為輸入,而blastp接受蛋白質序列作為輸入。

  3. 比對算法:blastn使用核酸序列間的堿基匹配來進行比對,而blastp使用蛋白質序列間的氨基酸匹配。

  4. 匹配評分:blastn使用核酸間的堿基匹配評分系統,而blastp使用蛋白質間的氨基酸匹配評分系統。

  5. 輸出結果:blastn的輸出結果會給出兩個核酸序列之間的相似度和比對位置等信息,而blastp的輸出結果會給出兩個蛋白質序列之間的相似度、比對位置以及預測的結構和功能等信息。

總的來說,blastn和blastp是針對不同類型的生物分子序列設計的搜索工具,分別用于核酸序列和蛋白質序列的比對和分析。

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