是的，MATLAB的plotyy函數可以用來繪制兩條線，并且可以為這兩條線指定不同的顏色。plotyy函數的基本語法是：
plotyy(x, y1, x, y2, 'PropertyName1', value1, 'PropertyName2', value2, ...)
其中，x和y1是第一組數據，x和y2是第二組數據。你可以通過'PropertyName1', value1, 'PropertyName2', value2, ...來指定線的屬性，包括顏色。
例如，如果你想繪制兩條線，一條紅色，一條藍色，你可以這樣做：
x = [0, 1, 2, 3];
y1 = [1, 4, 9, 16];
y2 = [1, 1, 1, 1];
plotyy(x, y1, x, y2, 'Color', 'r', 'Color', 'b')
在這個例子中，'Color', 'r'將第一條線的顏色設置為紅色，'Color', 'b'將第二條線的顏色設置為藍色。
注意：在較新版本的MATLAB中，plotyy函數可能已被棄用，建議使用其他函數，如plot結合hold on和plot等方式來實現類似的功能。但是，plotyy在一些舊版本的MATLAB中仍然可用，所以如果你正在使用的是一個較舊的版本，那么上述方法仍然適用。
