Neo4j是一個高性能的NoSQL圖形數據庫，它具有自動創建索引的功能，以提高查詢性能。然而，在某些情況下，自動索引可能會導致性能問題。以下是一些建議和優化方法：

1. 使用原生ID查詢：在某些情況下，使用Neo4j的原生ID進行查詢可能會比使用節點的屬性進行查詢更快。因為使用原生ID查詢時，不需要訪問索引。

Node node = graphDatabase.getNodeById(id);

2. 只在需要時創建索引：在某些情況下，可能不需要為某個屬性創建索引。只有在執行查詢時，才會發現沒有索引的情況。在這種情況下，可以考慮在需要時手動創建索引。

graphDatabase.createIndex("User_Email", User.class);

3. 使用原生ID進行批量查詢：如果你需要查詢多個節點，使用原生ID進行批量查詢可能會比逐個查詢更快。

List<Node> nodes = graphDatabase.getNodesByIds(ids);

4. 使用原生ID進行更新和刪除操作：與查詢類似，使用原生ID進行更新和刪除操作可能會比使用屬性進行操作更快。

Node node = graphDatabase.getNodeById(id);
node.setProperty("property", value);
graphDatabase.save(node);

5. 考慮使用原生ID進行路徑查詢：在某些情況下，使用Neo4j的原生ID進行路徑查詢可能會比使用Cypher查詢更快。

List<Node> nodes = graphDatabase.getNodesByIds(startId, endId);

6. 避免過度索引：雖然自動索引可以提高查詢性能，但過多的索引可能會導致插入、更新和刪除操作的性能下降。因此，在創建索引時，請確保仔細考慮其必要性。

7. 定期分析和優化數據庫：定期分析數據庫的性能，找出瓶頸并進行優化。這可能包括刪除不再需要的索引、優化查詢語句等。

8. 使用投影：在執行查詢時，盡量只返回所需的屬性，而不是整個節點或關系。這樣可以減少數據傳輸量，提高查詢性能。

MATCH (n) RETURN n.property AS property

總之，在使用Neo4j自動索引時，需要根據實際情況進行優化。通過合理地使用原生ID查詢、避免過度索引、定期分析和優化數據庫等方法，可以有效地提高查詢性能。