要刪除三維數組中的空值，可以使用遞歸函數來實現。以下是一個示例代碼：

function removeEmptyValues(&$array) {
    foreach ($array as $key => &$value) {
        if (is_array($value)) {
            removeEmptyValues($value);
            if (empty($value)) {
                unset($array[$key]);
            }
        } else {
            if (empty($value)) {
                unset($array[$key]);
            }
        }
    }
}

$threeDimensionalArray = [
    [1, 2, 3],
    [4, '', 6],
    [[7, '', 9], [10, 11, '']],
];

removeEmptyValues($threeDimensionalArray);

print_r($threeDimensionalArray);

在上述代碼中，removeEmptyValues 函數將傳入的數組作為引用，在函數內部進行遞歸遍歷，檢查數組元素是否為空。如果是空數組或者空字符串，就使用 unset 函數將該元素從數組中刪除。最后，打印處理后的三維數組。

執行上述代碼后，將會得到以下輸出：

Array
(
    [0] => Array
        (
            [0] => 1
            [1] => 2
            [2] => 3
        )

    [1] => Array
        (
            [0] => 4
            [2] => 6
        )

    [2] => Array
        (
            [0] => Array
                (
                    [0] => 7
                    [2] => 9
                )

            [1] => Array
                (
                    [0] => 10
                    [1] => 11
                )

        )

)

可以看到，空值已經被成功刪除。