合租虛擬主機的缺點有：1、容易引起合同糾紛，技術力量不過關，管理也比較混亂，不能保證虛擬主機的安全；2、合租公司沒有增值電信經營許可證，沒有自己的機房，售后及產品質量難以保證；3、站點數量不透明，無法從合租人數上得到保證。
具體內容如下：
1、合同糾紛
個人發起的傳統合租項目容易引起糾紛，管理也比較混亂及技術力量不過關等，無法保證虛擬主機的安全穩定和相關維權工作，容易產生合同糾紛。
2、資質問題
據工信部最新期全國IDC運營商統計報表，全國總共擁有資質的IDC公司1100多家，而在行業市場真正從事服務器合租的IDC公司屈指可數。所以有很大部分的合租公司都沒有增值電信經營許可證，沒有自己的機房，只能選擇有資質的公司進行托管或者租用。所以售后及產品質量難以保證。
3、透明合租
合租產品的站點數量不透明，無法從合租人數上得到保證。目前支持透明合租的合租網站不多。
